Ensimmäinen sielunhoitoterapeuttien koulutus aloitettiin tammikuussa 2000.  Yhdistys perustettiin  vuonna 2003 RE-sielunhoitoterapeutit ry:n nimellä. RE on lyhenne sanoista Rikotusta eheä, joka on pastori ja terapeutti Seppo Jokisen kehittämä sielunhoitoterapiamalli.

Yhdistyksen nimi muutettiin v. 2009 Suomen sielunhoitoterapeutit ry:ksi, jolloin yhdistyksen tarkoitus laajeni kokoamaan eri sielunhoitoterapiakoulutusten suorittaneet henkilöt yhteistoimintaan. Yhdistyksen tavoitteena on kehittää ja edistää sielunhoitoterapiaa Suomessa.

Suomen sielunhoitoterapeutit ry

  • järjestää yhteiskristillisellä periaatteella Sielunhoitoterapia -seminaareja eli koulutus- ja virkistäytymispäiviä
  • julkaisee Sielunhoitoterapia -lehteä
  • pitää esillä sielunhoitoterapeuttien tarjoamia palveluja
  • tekee yhteistyötä terapiaa tai sielunhoitotyötä tukevien yhdistysten ja yhteisöjen kanssa
  • tarjoaa materiaalia terapeuttisia sielunhoitopäiviä varten
  • tarjoaa materiaalia seurakuntien rukouspalvelijoiden ja sielunhoitajien koulutusta varten
  • harjoittaa yhdistyksen tavoitteita ja tarkoitusta tukevaa tiedotustoimintaa
  • huolehtii jäsenistönsä sielunhoitoterapian laadunvalvonnasta
  • on Suomen ACC ry:n jäsen (Association of Christian Counsellors) 

Yhdistys on pitkälti ollut sielunhoitoterapeuttien oma yhdistys, mutta nykysuuntauksena on ollut kutsua mukaan yhdistyksen toimintaan myös sielunhoitoterapiasta kiinnostuneet henkilöt ja yhteisöt kannattajajäsenyyden kautta.